Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms