Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trp53i11Q4QQM4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms