Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nr1d1Q3UV55 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms