Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3USZ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q3USZ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms