Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skap2Q3UND0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skap2Q3UND0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms