Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330014E10RikQ3UL33 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330014E10RikQ3UL33 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms