Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx27Q3UHD6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx27Q3UHD6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms