Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hvcn1Q3U2S8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms