Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf149Q3U2C5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms