Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hace1Q3U0D9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms