Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fubp3Q3TIX6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms