Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prr27Q3SYJ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms