Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd11Q1RNF8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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