Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gata4Q08369 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms