Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLEQ07864 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLEQ07864 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLEQ07864 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLEQ07864 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLEQ07864 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLEQ07864 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms