Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms