Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox12Q04890 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms