Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox9Q04887 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox9Q04887 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms