Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnb1Q03717 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnb1Q03717 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms