Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrkcqQ02111 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms