Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms