Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms