Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Mesp1P97309 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms