Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf11P70378 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms