Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnab1P63143 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnab1P63143 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms