Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vamp3P63024 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms