Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arl1P61211 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arl1P61211 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms