Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ppfia3P60469 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms