Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csrnp3P59055 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrnp3P59055 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms