Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bace1P56818 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms