Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckbrP56481 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CckbrP56481 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms