Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms