Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PtpreP49446 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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