Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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