Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab20P35295 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab20P35295 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms