Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptk2P34152 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms