Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc11P31313 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc11P31313 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms