Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd28P31041 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd28P31041 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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