Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BgnP28653 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BgnP28653 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BgnP28653 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms