Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms