Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpcP21841 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SftpcP21841 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SftpcP21841 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpcP21841 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SftpcP21841 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SftpcP21841 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SftpcP21841 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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