Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcer1aP20489 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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