Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nme1P15532 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme1P15532 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme1P15532 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme1P15532 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms