Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sod1P08228 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms