Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TtrP07309 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TtrP07309 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TtrP07309 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TtrP07309 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtrP07309 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtrP07309 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtrP07309 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtrP07309 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TtrP07309 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms