Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms