Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01734 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01734 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01734 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01734 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01734 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01734 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01734 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01734 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01734 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms