Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl22O88430 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms