Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Col5a1O88207 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Col5a1O88207 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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