Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pole2O54956 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pole2O54956 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms